90年代中期，最为流行的电脑病毒是引导区病毒，主要通过软盘在16位元磁盘操作系统(DOS)环境下传播。引导区病毒会感染软盘内的引导区及硬盘，而且也能够感染用户硬盘内的主引导区(MBR)。一但电脑中毒，每一个经受感染电脑读取过的软盘都会受到感染。

　　引导区电脑病毒是如此传播：隐藏在磁盘内，在系统文件启动以前电脑病毒已驻留在内存内。这样一来，电脑病毒就可完全控制DOS中断功能，以便进行病毒传播和破坏活动。那些设计在DOS或Windows3.1上执行的引导区病毒是不能够在新的电脑操作系统上传播，所以这类的电脑病毒已经比较罕见了。
　　文件型电脑病毒

　　文件型电脑病毒，又称寄生病毒，通常感染执行文件(.EXE)，但是也有些会感染其它可执行文件，如DLL,SCR等等...每次执行受感染的文件时，电脑病毒便会发作：电脑病毒会将自己复制到其他可执行文件，并且继续执行原有的程序，以免被用户所察觉。

　　复合型电脑病毒

　　复合型电脑病毒具有引导区病毒和文件型病毒的双重特点。

　　宏病毒

　　宏病毒专门针对特定的应用软件，可感染依附于某些应用软件内的宏指令，它可以很容易透过电子邮件附件、软盘、文件下载和群组软件等多种方式进行传播如MicrosoftWord和Excel。宏病毒采用程序语言撰写，例如VisualBasic或CorelDraw，而这些又是易于掌握的程序语言。宏病毒最先在1995年被发现，在不久后已成为最普遍的电脑病毒。

　　特洛伊/特洛伊木马

　　特洛伊或特洛伊木马是一个看似正当的程序，但事实上当执行时会进行一些恶性及不正当的活动。特洛伊可用作黑客工具去窃取用户的密码资料或破坏硬盘内的程序或数据。与电脑病毒的分别是特洛伊不会复制自己。它的传播技俩通常是诱骗电脑用户把特洛伊木马植入电脑内，例如通过电子邮件上的游戏附件等。

　　蠕虫病毒

　　蠕虫是另一种能自行复制和经由网络扩散的程序。它跟电脑病毒有些不同，电脑病毒通常会专注感染其它程序，但蠕虫是专注于利用网络去扩散。从定义上，电脑病毒和蠕虫是非不可并存的。随着互联网的普及，蠕虫利用电子邮件系统去复制，例如把自己隐藏于附件并于短时间内电子邮件发给多个用户。有些蠕虫(如CodeRed)，更会利用软件上的漏洞去扩散和进行破坏。

　　其他电脑病毒/恶性程序码